2016年 深圳本土成长起来的大型综合性投资集团——佳兆业集团顺应足球市场发展趋势，投入巨资入股深圳市足球俱乐部，扛起了深圳职业足球的大旗；深足由此找准了新的发展方向，通过大力引援、革新管理等系列举措，吹响了再攀高峰的号角，走进了重启辉煌的全新时代。

2018年11月3日，经过三年艰苦努力，深圳佳兆业队以中甲联赛第二名成功冲超，时隔7年重返中国顶级联赛，为深圳这座城市赢得了荣誉。

2019年3月2日，深圳市足球俱乐部承办中超联赛开幕式，向全球96个国家和地区的观众展现了一场展现深圳高科技特色和本地非物质文化遗产的世界级文体盛宴；在随后联赛揭幕战中，深圳佳兆业队战胜河北华夏幸福队，开启了重返中超联赛的征程。

2011年 外号“白巫师”的法国名帅特鲁西埃成为球队的主教练，球队签下了日本球员卷诚一郎和乐山孝志两名日本球员，中超联赛史上首次出现日本外援；因让路大运会，深圳队要将大部分主场比赛迁到惠州博罗体育中心进行，球队经常要在惠州和深圳两个城市往返，球队由于战绩不佳不幸降入中甲。

2012年 因球队阵容变动较大，仅取得中甲联赛第七名的成绩，未能实现赛重返中超目标。

2013年 深足主场取得11胜2平2负的骄人战绩，外援巴巴卡表现出色，连续两年荣获最佳射手，球队最终排名第五；赛季末，前国足队员李毅接替合约期满的特鲁西埃成为球队代理主教练。

2014年 继续由李毅担任主教练，在困境中顽强拼搏，最终排名联赛第8名。

2015年 球队先后由李毅、李林生（韩国籍）、李海强担任主教练，虽处动荡，但球队仍克服重重困难，以联赛第12名成功保级。

2006年 球队获赞助冠名为深圳金威啤酒队，这个赛季聘请了王宝山担任主教练，开始以年青球员为主力，获得联赛第11名。

2007年 球队获赞助冠名为深圳香雪上清饮队，以联赛第14名惊险保级。

2008年 球队由深圳市足协托管，中超保级成功；球队搬离创队后便一直使用的训练基地——笔架山基地，为2011年世界大学生运动会让位。

2009年，红钻集团收购深足全部股份，球队在联赛最后10轮取得的不败战绩，完成了保级。

2010年，前贝尔格莱德红星队主教练高歌奇成为主教练，球队获赞助冠名为深圳茅台红钻队，球队最终排名第12位保级成功。

2002年 获得联赛亚军，这是深足在甲A时代的最佳成绩；12月，健力宝集团全资收购深圳足球俱乐部。

2003年 俱乐部更名为深圳健力宝足球俱乐部，队中拥有李玮锋、李毅、杨晨、郑智、郑斌等国脚，成为当时拥有现役国脚最多的球队，加上阵中多名外援国脚和本土实力球员，被球迷称作“皇家健力宝”。

2004年 夺得了首个中超联赛冠军，成为首支夺得顶级联赛冠军的广东省球队，并且获得了参加2005年亚洲冠军联赛的资格。

2005年 队中威望极高的主教练朱广沪被离开球队担当国家队主教练，引致队内一批主力球员出走，球队实力大受影响；即便处境艰难，球队依旧在杯赛中打出了坚韧不屈的深足精神，获得中超杯亚军，亚洲冠军联赛四强，创造了深足神话。

1994年 深足在中国足坛名宿容志行等人牵头创建，当年获得乙级联赛冠军，升入甲B。

1995年 获得甲B联赛冠军，升入甲A，完成“深圳速度三级跳”。

1996年 获赞助以深圳飞亚达队参加甲A联赛，因实力及经验不足，最终获得联赛第11名，不幸降入甲B。

1997年 平安保险集团全资收购深圳足球俱乐部，俱乐部冠名为深圳平安，获得甲B联赛亚军，重新得到甲A联赛晋级资格。

1998年 俱乐部聘请韩国足坛名宿车范根担任主教练，车范根是俱乐部首位外籍主教练，年底收购了火车头（杉杉）足球队，当中包括李玮峰等十六名极有潜质的火车头队年轻队员。

1999年 获全国甲A联赛第十二名，最后一轮保级成功。

2000年 当年5月朱广沪接替巴西人塔瓦雷斯成为深圳足球队的主教练，获甲A联赛第九名。

2001年 在主教练朱广沪的带领下，球队获得了联赛第五名。